Gitee 推荐 | 高性能云计算平台 HPC-NOW

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1. 项目背景

云上的高性能计算( Cloud High-Performance Computing, Cloud HPC ),与本地集群相比,有多方面的区别。其中最为显著的区别,就是云资源的弹性、动态与灵活性。理论上讲,您可以轻松使用多个云计算机的计算、存储、网络资源,您的超算集群规模可以扩展到数百、数千核心,也可能根据实际情况减小到 0 个计算核心。这种动态特点就意味着,您在一定程度上需要关心底层资源 —— 例如集群的规模、集群的数量等。

然而,资源管理对于广大的 Cloud HPC 用户来说,是比较陌生的;尤其是云资源的管理,更是无从下手。云提供海量的底层资源,但是 Cloud HPC 用户首先需要让这些资源组成具备超级计算能力的集群。这也就意味着需要一个 构建和运行 的过程。这个过程,对于大多数用户来说,难度非常高,原因在于它涉及到多方面的 IT 应用知识和云计算技能,包括但不限于:

  • 什么是网络、虚拟私有网络、子网、网段、ACL、公有和私有 IP ……
  • 什么是云主机、主机镜像、安全组、公钥私钥 ……
  • 什么是云硬盘、文件存储、对象存储、挂载不同类型的存储 ……
  • 什么是任务调度器、调度器如何配置和运行、超算用户如何使用和提交任务 ……
  • ……

以上种种,都成为了制约 Cloud HPC 走向更广阔应用的一道门槛。目前,这些工作要么是由云厂商以自研的方式、面向 HPC 用户推出自有的 Cloud HPC 服务,要么是由第三方服务商进行集成开发之后以类 SaaS 平台的方式提供给客户。无论是哪一种方案,都旨在将客户留在各自的平台上;尽管在商业方面是完全合理而且完全值得尊重的,但是无形之中会限制最终用户对于超算的掌控权以及选择 Cloud HPC 服务的自由度。

为了打造全面开放且超级简单的 Cloud HPC 平台,让用户能够以极低的门槛开启 Cloud HPC,加速科研创新,我们打造了开源的云超算平台 HPC-NOW。这里,NOW 有两层含义:

  • 现在即可开始,无需等待
  • No Operation Workload,无需繁重的运行维护工作,即可在云上轻松管理您的超算集群和超算服务

希望与您共同携手打造开源、开放的 Cloud HPC 生态!

2. 核心组件

首先,在此鸣谢卓越、开源、面向多云的 IaC( 基础设施即代码 )平台 Terraform。正是 Terraform 强大的功能和良好的生态为 HPC-NOW 提供了坚实的基础,我们可以不必重复造轮子。本项目的核心工作,在于如何驱动 Terraform 来构建和管理一个或多个 Cloud HPC 集群。

本项目的核心组件如下:

  • installer :HPC-NOW 服务的安装器。主要负责服务的安装、卸载、更新三项工作。该安装器被设计为必须由管理员权限执行。
  • hpcopr :意即 HPC Operator,是 HPC-NOW 的核心程序,也是用户需要执行的主程序。为了确保安全性和隔离性,该程序被设计为必须由专属 OS 用户 “hpc-now” 执行,其他用户,即使是管理员用户或者根用户也无法执行。由 hpcopr 管理基础设施代码,并调用 Terraform 对云资源进行全生命周期管理。
  • now-crypto :辅助程序,主要作用是简单的文件加密和解密,以确保敏感信息不以明文形式存放。请注意,该程序不是严格的加解密程序,仅通过统一偏移字符的方式对文本信息进行修改,您的密文文件仍需要妥善保管。一旦密文文件泄露,他人可能通过穷举得到您的文本偏移量,从而反向偏移得到原文。
  • hpcmgr :强大的集群内管理工具,包括集群的连接、SLURM 服务的启动、以及 HPC 软件包的自动化编译安装等。
  • templates :模板文件是 IaC(基础设施及代码)的核心要素,我们已经针对 AWS、阿里云、腾讯云 三家公有云厂商制作了专用的资源模板,后续将进一步接入微软 Azure、GCP、华为云等三家云资源
  • scripts :启动脚本包含了集群各个节点启动过程的编排,包括各类必要组件的自动化安装。

3. 构建环境需求

我们使用 C 语言和 GNU/Linux Shell 脚本进行整个平台的构建。其中,三个核心程序 installerhpcoprnow-crypto 均为纯 C 语言编写。C 语言跨平台和偏底层的特点,使得其适合用来进行核心程序的开发。对于这三个核心程序而言,构建过程仅需要 C 语言编译器即可,在三个主流操作系统方面,需要安装的 C 语言编译器略有不同。

  • Microsoft Windows :您需要安装最新版 mingw,具体请参考 CSDN 上的教程,或者参考其他公开来源的教程。请务必注意安装完 mingw 之后,需要将 mingw 安装目录下面的 bin 文件夹路径添加到系统环境变量 PATH 中
  • GNU/Linux :您需要安装 GNU Compiler Collections,也就是我们熟知的 gcc。目前主流的版本一般为 8.x.x 及以上。您可以从操作系统自带的软件仓库中安装,如 yum 或者 apt,示例命令:sudo yum -y install gcc 或者 sudo apt-get install gcc
  • macOS :您需要安装 clang,版本一般为 13.x.x 及以上。如果您的 mac 设备未安装过 clang 编译器,您可以尝试打开 Terminal 并输入 clang,如果本机没有安装clang,macOS 会询问是否安装,您授权之后可根据提示进行自动安装

安装完之后,请您在命令提示符或者终端中输入 gcc --version 或者 clang --version 来确认编译器正确安装。

4. 如何构建

本项目的源代码尚未做比较好的拆分、注释也正在逐步添加中。由于源代码以整文件的方式发布,其构建过程也比较基础,无需复杂的依赖和 make 工具链支持。您只需要运行 gcc 或 clang 命令即可完成构建。以核心程序 hpcopr 为例:

请从本项目的 dev 分支下载源代码至本地目录( 例如 /home/ABC/hpc-now-dev/ ),使用 ‘cd’ 命令切换至代码所在的本地目录之后:

  • Microsoft Windows用户 ,请运行:gcc hpcopr-windows.c -Wall -o hpcopr.exe
  • GNU/Linux用户 ,请运行:gcc hpcopr-linux.c -Wall -lm -o hpcopr
  • macOS用户 ,请运行:clang hpcopr-darwin.c -Wall -o hpcopr

此外,还需以相似的方式编译 now-crypto.c 和 installer-OS-VERSION.c,并将生成的可执行文件命名为 now-crypto.exeinstaller_OS_VERSION.exe

5. 如何使用

请参阅技术文档。请注意:如果您直接运行 installer 进行本地安装,将会下载云上已经编译好的 hpcopr 和 now-crypto 至以下本地目录:

  • Windows : C:programdatahpc-nowbinnow-crypto.exe 和 C:hpc-nowhpcopr.exe
  • GNU/Linu x:/usr/.hpc-now/.bin/now-crypto.exe 和 /home/hpc-now/.bin/hpcopr
  • macOS :/Applications/.hpc-now/.bin/now-crypto.exe 和 /Users/hpc-now/.bin/hpcopr

您可以用自己构建的 hpcoprnow-crypto 替换掉安装时下载的文件,请注意文件名保持一致即可。此外,在 GNU/Linux 和 macOS 下,注意要赋予可执行权限,示例命令:

  • sudo chmod +x now-crypto

6. 关键目录

hpcopr 安装部署之后,将会对您的操作系统进行如下修改。具体的修改操作请阅读 installer 源代码的 int install_services(void) 函数内容。

  • 创建一个 名为 hpc-now 的操作系统用户 ,对于 Microsoft Windows,该用户将生成初始密码 nowadmin2023~ ,并且在首次以 hpc-now 用户登录时强制要求修改;对于其他操作系统,无初始密码,您需要按照说明为该用户设置密码
  • 创建工作目录 ,对于 Microsoft Windows,将创建 C:hpc-now 目录作为关键工作目录,创建 C:programdatahpc-now 作为关键数据目录;对于 GNU/Linux,关键工作目录位于 hpc-now 的家目录下,即:/home/hpc-now,关键数据目录位于 /usr/.hpc-now ;对于 macOS,关键工作目录位于 hpc-now 的家目录下,即:/Users/hpc-now,关键数据目录位于 /Applications/.hpc-now 。

上述对操作系统的修改均不会无意或恶意破坏您的操作系统。同时, 您可以随时以管理员身份执行 sudo YOUR_INSTALLER_FULL_PATH uninstall 操作回滚上述对操作系统的改动 。请注意,uninstall 操作可能会导致您对云上的集群失去管理权,请务必按照软件说明进行确认操作。

如有任何疑问,请您阅读源代码、或者联系我们进行技术沟通。

7. 核心功能

如前所述,hpcopr 是您操作和管理 Cloud HPC 集群的核心界面。 hpcopr 目前以命令行的形式提供多种功能。您可以运行 hpcopr help 命令查看详细的帮助信息,主要如下:

hpcopr command_name PARAM1 PARAM2

初始化:

  • hpcopr new PARAM – PARAM 为必选参数,且只能为 workdir 或者 keypair。当 PARAM 为 workdir 时,将创建一个新的工作目录,并加密保存云服务密钥对,后续可进入该目录创建您的集群;当 PARAM 为 keypair 时,需要首先 cd 到一个工作目录,并将轮换该目录对应的云账户密钥对
  • hpcopr init PARAM – 初始化一个集群。其中,PARAM为可选项,用于指定集群的ID。如不指定,将使用默认的ID:hpcnow 。示例命令:hpcopr init my-first-cluster
  • hpcopr conf – 生成默认的集群配置文件,位于工作目录的 conf 文件夹内,您可进行修改之后再运行 hpcopr init 命令创建自定义配置的集群

一般管理:

  • hpcopr help – 在当前窗口显示完整的帮助信息
  • hpcopr usage – 查看最新的集群用量表,该命令将导出一份 CSV 格式的文本文件,您可以使用相关软件查看
  • hpcopr syslog – 查看集群管理相关日志,包括扩容、缩容、销毁、创建等,包括操作时间、操作内容、是否成功等
  • hpcopr vault – 将以加密方式存储的集群敏感信息以明文形式显示在当前窗口。包括集群登录 IP 地址、登录密码、网盘登录密码等
  • hpcopr graph – 查看当前集群的拓扑和配置。通过 graph,您可以直观的看到该集群的节点配置、节点地址、运行状况等

集群操作:

  • hpcopr delc PARAM – 删除计算节点。您既可以指定 PARAM 为 all,用于删除所有计算节点;也可以指定 PARAM 为一个正整数,用于删除指定数量的计算节点。示例命令: hpcopr delc 1 或 hpcopr delc all
  • hpcopr addc NUM – 增加计算节点,其中 NUM 为您指定要添加的节点数目。示例命令:hpcopr addc 3
  • hpcopr shutdownc PARAM – 关闭计算节点。与 hpcopr delc 类似,您可以指定 PARAM 为 all 或者要关闭的计算节点数量
  • hpcopr turnonc PARAM – 开启计算节点,与 hpcopr shutdownc 命令类似,您可以指定 PARAM 为 all 或者要启动的计算节点数量
  • hpcopr reconfc PARAM1 PARAM2 – 计算节点配置变更。您可以将 PARAM1 和 PARAM2 留空,用于查看支持的节点配置列表;PARAM1 是新配置的名称;PARAM2可选,为超线程开关(仅限于 AWS | 亚马逊云科技)。示例命令:hpcopr reconfc i4c8g
  • hpcopr reconfm PARAM – 更改管理节点的配置。用法与 hpcopr reconfc 类似,但是不支持超线程选项
  • hpcopr sleep – 关闭整个集群,包括所有的管理节点和计算节点
  • hpcopr wakeup PARAM – 唤醒集群,您可以指定 PARAM 为 all 或者 minimal。当 PARAM 为 all 时,集群内所有节点都会打开;当 PARAM 为 minimal 时,仅打开管理节点
  • hpcopr destroy – 销毁当前的集群,包括所有节点和数据。请务必在确认销毁前妥善保存好您的关键数据

8. Bug与技术沟通

欢迎随时联系 info@hpc-now.com

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正文完
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